Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms