Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFIP11Q9UBB9 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms