Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLVAPQ9BX97 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms