Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CNPPD1Q9BV87 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CNPPD1Q9BV87 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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