Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARRDC4Q8NCT1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARRDC4Q8NCT1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms