Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms