Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms