Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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