Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms