Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX3P78415 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX3P78415 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms