Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LMO4P61968 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LMO4P61968 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LMO4P61968 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms