Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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