Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms