Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD4P46934 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms