Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MLH1P40692 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms