Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms