Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFNP31947 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFNP31947 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms