Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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