Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTMAP06454 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTMAP06454 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTMAP06454 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms