Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LTAP01374 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LTAP01374 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LTAP01374 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LTAP01374 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LTAP01374 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LTAP01374 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LTAP01374 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LTAP01374 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LTAP01374 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LTAP01374 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LTAP01374 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LTAP01374 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LTAP01374 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms