Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ZBED1O96006 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZBED1O96006 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZBED1O96006 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZBED1O96006 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ZBED1O96006 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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