Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms