Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HMGB1P1B2RPK0 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms