Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNPO2Q9UMS6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms