Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB4Q9UDY4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms