Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTTNBP2NLQ9P2B4 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms