Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM6Q9C030 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms