Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM3Q9BZL3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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