Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms