Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms