Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATG16L1Q676U5 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms