Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms