Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPP3CAQ08209 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms