Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP7AQ04656 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms