Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 AC025165.4-201ENST00000602327 433 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 ENTPD1-AS1-210ENST00000452942 864 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NESP48681 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NESP48681 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NESP48681 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms