Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCNA2P20248 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCNA2P20248 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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