Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms