Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms