Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms