Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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SCN2BO60939 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SCN2BO60939 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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