Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
O00370 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
O00370 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
O00370 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
O00370 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
O00370 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
O00370 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
O00370 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
O00370 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
O00370 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
O00370 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
O00370 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
O00370 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
O00370 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
O00370 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
O00370 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms