Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms