Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC66A2RUB6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms