Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms