Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX9Q9Y5X1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX9Q9Y5X1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX9Q9Y5X1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms