Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
YIPF1Q9Y548 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF1Q9Y548 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YIPF1Q9Y548 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YIPF1Q9Y548 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YIPF1Q9Y548 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
YIPF1Q9Y548 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF1Q9Y548 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms