Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAB1Q9Y478 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms