Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms