Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRG3Q9Y2Y8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG3Q9Y2Y8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms