Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP3Q9Y2W7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms